Sam, um fuzileiro americano na embaixada de Moscovo antes das bombas serem lançadas, sonha há muito em voltar à sua terra natal e talvez encontrar a sua família com vida. Esta perspetiva parecia impossível nos túneis escuros do Metro, mas quando os espartanos descobriram que Moscovo não era a única cidade a sobreviver à guerra, esta esperança repentinamente não parecia tão absurda.
Sam abre o seu caminho para longe de Aurora à procura de uma forma de retornar ao seu lar nos EUA, e chega às ruínas de Vladivostok, onde os portos foram dizimados por maremotos, os edifícios industriais estão arruinados e os distritos residenciais estão a cair aos pedaços. Para completar a sua jornada, Sam descobrirá que terá de usar todas as táticas que aprendeu até então para sobreviver, já que tudo ao seu redor tem provado ser mais traiçoeiro do que ele esperava.
Os jogadores desbravarão o caminho de Sam pela paisagem de desafio à sobrevivência de Vladivostok, conforme embarcam numa jornada totalmente nova pelo desterro da Rússia pós-apocalíptica.