Real Bout traz mudanças significativas nos controles em relação aos jogos anteriores da série Fatal Fury. O número de botões de ataque foi reduzido de quatro para três: um botão de Soco, um de Chute e um de Ataque Forte, que varia entre um soco ou chute mais potente, dependendo do personagem.
O jogo mantém o sistema de três planos de movimentação ("oversway") introduzido em Fatal Fury 3. Nesse sistema, além da linha principal de combate, há planos no primeiro plano e plano de fundo, usados para evitar ataques ou se aproximar do oponente. Agora, há um botão exclusivo para mudar entre esses planos.
Outra novidade é a introdução da Barra de Poder (Power Gauge), que se preenche à medida que o jogador realiza ataques normais ou especiais, ou se defende. Assim como em outros jogos de luta, essa barra permite a execução de Técnicas Especiais, que variam de acordo com o nível de carga da barra.
Real Bout também adiciona estágios com ring-out, uma mecânica popularizada em jogos de luta 3D como Virtua Fighter. Se o jogador usar certos ataques perto das bordas da arena, é possível destruir a barreira e lançar o oponente para fora do ringue, garantindo uma vitória rápida.
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