Super Meat Boy é um jogo de plataforma 2D em ritmo acelerado que recompensa a perfeição mecânica e a precisão dos controles.
Meat Boy tem que salvar Bandage Girl do Doctor Fetus, completando os desafios de plataforma.
O jogo tem 5 mundos principais, cada um composto por 20 níveis de luz, 20 versões escuras e mais difíceis desses níveis e uma luta de chefe. Meat Boy tem apenas uma vida e não pode sofrer nenhum dano, mas não há limite de tentativas, então os jogadores podem tentar e falhar no estágio até acertar ou coletar bandagens especiais.
O sistema de repetição exclusivo mostrará ao jogador todas as tentativas que ele fez ao mesmo tempo logo após completar o nível. Super Meat boy tem vários personagens, alguns deles são uma skin diferente para Meat Boy e adaptações no jogo de outros protagonistas de jogos indie, que podem ser desbloqueados completando seus níveis de desafio especiais, escondidos em algum lugar da campanha; ou coletando quantidade definida de bandagens. Os jogadores poderão escolher qualquer personagem desbloqueado para qualquer nível no menu principal. O jogo dá aos jogadores acesso aos mapas criados pela comunidade, mas mesmo sem ele – Super Meat Boy oferece mais de 300 níveis.