SNK vs. Capcom: SVC Chaos utiliza principalmente o sistema de comandos da série The King of Fighters, incorporando chutes e socos fracos e fortes, cancelamentos e ataques carregados. Diferentemente de seu antecessor, Capcom vs. SNK 2, este jogo não possui defesa aérea nem um «sistema de estilos» (groove system), concentrando-se, em vez disso, em uma jogabilidade mais rápida. Os personagens contam com uma barra básica de três níveis para executar ataques superespeciais, que pode ser preenchida de maneiras simples, como ao acertar golpes ou receber dano. Além disso, os sprites das várias séries receberam novos modelos, e alguns efeitos especiais foram alterados nas listas de comandos (por exemplo, não é mais possível aumentar, pressionando os botões repetidamente, o dano do Zujou Sashi usado por Choi Bounge).