Faça parte da aventura animada da Dreamwork guiando Marty, a zebra, Alex, o leão, Melman, a girafa, Gloria, o hipopótamo, e aqueles pinguins furtivos enquanto escapam do Zoológico do Central Park para as ruas de Nova York e depois para a selva selvagem... err zoológico de San Diego.
O enredo é exatamente o mesmo que o próprio filme e cada capítulo o levará mais adiante na história. Cada capítulo terá vários objetivos definidos. Apenas um objetivo específico por capítulo é necessário para completar o capítulo, então você sempre pode repetir o capítulo mais tarde para tentar completar todos os objetivos.
Cada estágio também exigirá que você jogue como um personagem diferente e alguns envolverão todos os personagens.
Cada personagem tem suas próprias habilidades únicas: Marty pode chutar com as patas traseiras, esgueirar-se por seus inimigos, deslizar e realizar saltos longos. Alex, o leão, pode atirar frutas, usar suas garras e rugir contra seus inimigos. Gloria pode cair, pular de bunda e checar o quadril em seus inimigos. E quando ela comer algumas pimentas, ela poderá atacar seus inimigos. Melman pode girar, jogar itens e bater a cabeça em seus inimigos. Ele também pode executar o movimento de helicóptero que lhe permite planar longas distâncias. Finalmente, o Pinguim pode deslizar, pescar e atacar com um movimento de acabamento (algo como um golpe de caratê) para derrotar seus inimigos.
Ao longo do jogo, haverá vários itens para coletar, incluindo Life Tikis para reabastecer seu Medidor de Saúde e Dinheiro de Macaco, que permitirão que você compre coisas especiais na Loja Zoovenir, como minijogos e roupas especiais para o elenco de Madagascar.
