As versões Famicom/NES do Contra são uma versão expandida da versão arcade, desenvolvida internamente. A maior diferença é que os níveis são reestruturados e significativamente mais longos, com os estágios 5 a 8 sendo derivados e expandidos de áreas no estágio final da versão arcade. O enredo também é alterado, sendo ambientado no ano de 1987 na Amazônia, em vez de 2633 no arquipélago de Galuga. As armas são ligeiramente diferentes em função e frequência, e o Código Konami faz uma aparição famosa. A versão Famicom tem efeitos gráficos adicionais e cenas entre missões não vistas na versão NES.