Você joga como um jovem adolescente chamado Jude Maverick. Você vive em uma vila tranquila que flutua bem acima do solo, inconsciente do mundo que está abaixo dela. Mas um dia, seu mundo se despedaça e você desce à terra para enfrentar a terrível realidade: o mundo de Filgaia foi devastado por guerras. Alguns assentamentos em meio a tanques enferrujados é tudo o que resta da civilização. O governo democraticamente eleito tem alguns planos para melhorar as condições do mundo, mas quando você conhece uma jovem que eles usaram como ferramenta para seu propósito, você percebe que deve encontrar um plano melhor para salvá-la, e ao mundo, da completa destruição.
A quarta parte da série Wild Arms abandona seu tema tradicional do Velho Oeste e se passa em um mundo pós-apocalíptico. O sistema de jogo introduz batalhas hexadecimais. As telas de batalha são divididas em sete hexágonos, cada um dos quais pode conter vários membros do grupo ou inimigos. Você navega seus personagens no campo de batalha, tentando forçar o inimigo a uma posição desconfortável. Há também uma variedade de habilidades que você pode aprender e aplicar em batalhas para obter benefícios. Como nos jogos anteriores do Wild Arms, as masmorras contêm muitos quebra-cabeças ambientais para resolver.
