Teenage Mutant Ninja Turtles 3: Mutant Nightmare é um videogame publicado pela Konami para o PlayStation 2, GameCube, Xbox e Nintendo DS, apresentando as Tartarugas Ninja. O jogo é dividido em quatro seções, chamadas "Episódios" (uma é desbloqueada na conclusão do terceiro episódio): Space Invaders, lidando com os arcos de abertura da terceira temporada, Space Invaders e Worlds Collide; Bishop's Gambit, baseado no episódio homônimo da terceira temporada e apresentando antagonistas de outros dois episódios; Exodus, detalhando os eventos de New Blood e Exodus em duas partes; e finalmente The Nightmare, baseado nos cinco episódios em que Ultimate Drako separou as Tartarugas e Splinter em diferentes dimensões. Depois de competir no episódio 1 de Teenage Mutant Ninja Turtles: 3 Mutant Nightmare, o jogador desbloqueará uma versão ligeiramente alterada do jogo de arcade, Teenage Mutant Ninja Turtles: Turtles in Time, que é um videogame mais antigo da série também feito pela Konami.