Phantom Blade Zero reúne muitos confrontos contra chefes, em sua maioria ligados à história principal. Também há inimigos opcionais, e alguns deles são importantes para alcançar o final perfeito.
As lutas têm um recurso que pode facilitar a progressão: se o personagem morrer durante a segunda ou a terceira fase de um chefe, ele retorna ao começo daquela mesma fase. Além disso, alguns adversários reaparecem em confrontos posteriores ou dentro das figueiras-de-bengala com rosto humano.
A lista abaixo reúne 61 registros de chefes e suas regiões. Atenção: há spoilers de partes avançadas da campanha e do final.
Vale do Riacho das Lágrimas
Zuo Shang, Soberano das Sombras da Ordem
A Caçada, Caçador da Ordem
Marionete Aberrante de Três Faces
Aço Serrilhado, Bruto Frenético
Peng Meng, Mestre do Machado
Hua, Noiva Mortal
A Caçada, Foice Séxtupla
Catador de Marionetes e Acólito Hansui
Chefe que aparece em várias regiões
O Mascarado Dourado — Vale do Riacho das Lágrimas, Floresta Carmesim, Lago Meigu, Ruínas do Ilusionista e Propriedade da Miragem.
Floresta Carmesim
Hua Qianxiao, Fanático pela Espada
Jing Ye, o Fora da Lei
Mão de Pedra, Febre de Ferro
Bai Chilian, Senhora das Serpentes Gêmeas
Dançarina de Jade, Guardiã da Jovem Senhora, e Demônio de Ferro, Guardião da Jovem Senhora
Yucong, Marionete Distorcida nº 34
Vila de Lu
Zhuo Bi, Guardião do Portão
Mestre Bi Yuan, da Seita Tianxuan
Mestre Bi Hai, do Templo Kuye
Acólito Yanryu
Dusk, o Marionetista
Yuzan, Marionete Músico nº 3
Mu Xiaokui, Jovem Senhora da Ordem
Pangzhen
Blaze, Capitão dos Guardiões das Sombras / Consciência Fosfórica
Algoz da Cavalaria, Guerreiro de Elite das Sombras
Wu Xuan, o General Caído
Gu Wanyue, a Aparição Lamentosa
Xie Qiudong, o Curandeiro Divino
You Loong, Líder da Tripulação da Água Negra
Chang Hong, a Lança do Trovão
Flame, Grão-Mestre da Dança do Leão com Máscara
Acólito Lei Ting
Reivindicador de Almas, Guardião de Elite das Sombras
Acampamento do Mandato
Xue, Devorador de Cadáveres
Wan Jun, o Malho de Cobre
Red, a Aparição Misteriosa
Wu Lengshuang, a Espada Flexível
Discípulo-Chefe da Formação das Sete Estrelas
Yubi, Marionete Espadachim nº 21
Lago Meigu
Yan Qaansui, a Dama da Cítara
Jin, Consumido pela Dor
Acólito Guhe
Arqueiro Caolho
You Loong, Líder Frenético da Tripulação da Água Negra
Zhu Yuan, a Lâmina Abrasadora
Perfurador de Corações, Guardião de Elite das Sombras
Montanha do Aprisionamento
Açougueiro de Ferro, Bruto Frenético
Bi Feng, Comandante do Sabre Gigante
Kui Yanyan, a Perturbada
Assassino da Máscara de Ferro
Rosto de Jade
Huangxing, o Renegado de Kunlun
Ruínas do Ilusionista Fantasma
Mestre da Lâmina da Nevasca
Propriedade da Miragem
Yuding, Marionete da Lâmina Crescente nº 12
Qiu Feng, a Lâmina de Osso Carmesim
Lei Dang, o Canhão do Tigre
Mo Yuan, Líder da Fortaleza de Mo
Monte Soulrend
A Serra e o Esmagador
Leng Tu, Arauto do Véu
Meng Hua, a Dama Misericordiosa do Véu das Flores
Zuo Shang, Soberano das Sombras da Ordem
Zuo Shang, o Verdadeiro Long
