A versão para Mega Drive/Genesis, desenvolvida pela Clockwork Tortoise e publicada pela Sega, é um jogo de ação do gênero *run and gun* em que Batman e Robin precisam deter o Sr. Frio, que planeja congelar Gotham City. Para manter a dupla ocupada, ele também liberta o Coringa, Duas-Caras e o Chapeleiro Louco, cada um com seus próprios planos. O Coringa comemora seu aniversário espalhando o caos por Gotham e roubando diamantes; Duas-Caras tenta dominar a cidade do alto; e o Chapeleiro Louco está criando um exército de robôs em seu esconderijo surreal.
O jogo pode ser jogado por duas pessoas simultaneamente: uma controla Batman e a outra, Robin. Os dois personagens são idênticos em termos de jogabilidade e usam batarangues, boleadeiras ou shurikens para atacar à distância, além de golpes corpo a corpo a curta distância. Há quatro níveis, cada um composto por várias fases, que em sua maioria consistem em avançar da esquerda para a direita até o fim, onde o chefe aguarda. Em alguns níveis, o jogo passa a ser um jogo de tiro com rolagem lateral, no qual os jogadores precisam controlar os Bataviões.
O jogo é considerado extremamente difícil de concluir e também é conhecido por apresentar alguns dos efeitos especiais mais impressionantes do Mega Drive/Genesis. Ele também conta com uma trilha sonora composta por Jesper Kyd. Isso explica a qualidade relativamente alta das composições de Kyd, assim como a natureza bastante simples dos efeitos sonoros sintetizados em FM.