Star Fox Command permite que você entre na luta por meio de uma história única e ramificada de missões, todas renderizadas em 3D deslumbrante. Este jogo traz um elemento estratégico totalmente novo à série, com a visão do comandante sobre a missão. Usando a tela sensível ao toque, os jogadores podem traçar as rotas que eles e seus companheiros de equipe seguirão. Lute contra os inimigos que encontrarem enquanto eles tomam bases e avançam estrategicamente pelo mapa. Os jogadores também podem derrubar seus amigos do céu, enquanto lutam contra 8 jogadores por uma conexão sem fio local — ou enfrentam 4 jogadores do mundo todo pela Nintendo Wi-Fi Connection.