A história gira em torno de um elenco interconectado de personagens que possuem um poder que lhes permite ver e ouvir o que um personagem próximo vê. O jogo foi seguido por uma sequência para o PlayStation 2, uma releitura para o PlayStation 3 e uma adaptação cinematográfica.
Siren é dividido em etapas, cada uma ocorrendo em uma das dez áreas da vila de Hanuda, e organizada cronologicamente em uma tabela chamada "Link Navigator". Para completar um estágio, o jogador deve cumprir um objetivo primário que geralmente envolve alcançar um ponto de saída, subjugar inimigos mortos-vivos chamados "Shibito", ou encontrar um item. Objetivos em diferentes estágios são interconectados por meio de um efeito borboleta, e as ações de um personagem em um estágio podem desencadear um objetivo secundário em outro estágio.
Existem diversos itens espalhados por cada estágio que dão ao jogador mais informações sobre o pano de fundo do enredo. Uma vez obtidos, esses itens são arquivados em um catálogo e podem ser visualizados a qualquer momento durante a duração do jogo. Os personagens dos jogadores do jogo possuem um poder psíquico chamado "sightjack", que lhes permite ver e ouvir o que um Shibito ou humano próximo vê e ouve, e assim identificar sua posição, bem como obter conhecimento de suas atividades e da posição de objetos obtidos. Itens. A clareza de cada alvo depende da distância do personagem do jogador. Uma vez localizado um ponto de vista, ele pode ser atribuído a um dos botões do controlador para alternar facilmente entre vários pontos de vista. No entanto, o personagem do jogador é incapaz de se mover durante o uso da habilidade e, portanto, é vulnerável a ataques.
O jogo encoraja o jogador a evitar Shibito ao invés de lutar contra eles. Os personagens podem andar silenciosamente, evitar o uso de uma lanterna e agachar-se atrás de objetos para evitar a detecção. Certos objetivos da missão exigem que o personagem do jogador use itens e/ou o ambiente para distrair Shibito de sua atividade, para que eles atinjam um objetivo. Outros exigem que o jogador escolte um personagem não-jogador. Os personagens dos jogadores também podem gritar a qualquer momento para chamar a atenção de Shibito nas proximidades. Na maioria dos estágios, o personagem do jogador pode se esconder em certos lugares, como armários e trancar portas para impedir que Shibito entre. Quando um Shibito ouve um som feito pelo personagem do jogador, ele procura na direção de onde ouviu o som. Se um personagem for visto por um Shibito, este perseguirá o personagem para matá-lo com uma arma branca ou de longo alcance ou por estrangulamento. O Shibito também gritará para alertar outros Shibito próximos. Uma vez que o personagem tenha permanecido fora da vista do Shibito por um período de tempo, o Shibito desistirá e retomará seus hábitos habituais. As armas estão disponíveis para o jogador durante todo o jogo, variando de armas brancas a armas de fogo. Enquanto Shibito pode ser nocauteado em combate, eles não podem ser mortos e serão reanimados após um curto período de tempo. Se um personagem estiver ferido, ele pode se recuperar depois de algum tempo. Os personagens perderão resistência durante o combate e durante a execução.