Ambientado seis anos após o original, Raji: Kaliyuga expande o conflito, retratando não apenas uma guerra entre mortais, mas uma luta cósmica envolvendo deuses, asuras e forças místicas. O antigo senhor da guerra asura, Mahabalasura, rompe prematuramente os selos dos céus, quebrando o equilíbrio divino e mergulhando todos os reinos em uma guerra sem fim. A história gira em torno de Raji, agora uma guerreira experiente, e seu irmão mais novo, Darsh, um jovem andarilho dos sonhos assombrado por visões do passado e do futuro. Juntos, eles embarcam em uma jornada perigosa rumo ao Cume Eterno, atravessando diversos lokas (reinos). Seu destino está em jogo: eles salvarão o universo ou serão forçados a destruí-lo para pôr fim ao conflito? Raji: Kaliyuga apresenta dois protagonistas, permitindo que os jogadores assumam o papel tanto de Raji, a guerreira da fé, quanto de Darsh, o andarilho dos sonhos. Os personagens alternam de acordo com os eventos da história e atuam como companheiros um do outro. Raji utiliza artes marciais acrobáticas e empunha o divino Trishul, enquanto Darsh desperta imensos poderes, controlando Siddhis para manipular a gravidade, o tempo e a energia.
O jogo introduz um sistema de evasão personalizado para Raji e um sistema de geração de Siddhis para Darsh. Esses sistemas únicos proporcionam habilidades distintas de movimento e combate, permitindo que os jogadores criem seus próprios estilos de luta.
