Pokémon Pinball tem todos os recursos que você espera de um jogo de pinball, incluindo mesas de bônus, muitos bumpers e maneiras de marcar muitos pontos. Assim como em um jogo de pinball de videogame padrão, o botão esquerdo do D-pad e o botão A controlam os flippers, enquanto os gatilhos R/L são usados para sacudir a mesa. O problema aqui é que tudo é temático em Pokémon. Em vez de uma bola, você usa uma Pokébola. Em vez dos bumpers padrão, você joga a Pokébola contra outros Pokémon, e o objetivo final é, claro, "pegar todos". O jogo conta com 200 Pokémon, duas mesas principais e suporte para cabo de conexão.