Baseado em uma combinação entre a popular atração da Disneyland e o filme homônimo de 2003, o jogo acompanha Zeke Holloway pela mansão dos 999 fantasmas felizes, onde ele precisa resolver um mistério, ajudar os espíritos a descansar em paz e sair vivo da casa.
O jogo é uma aventura de ação em terceira pessoa. Os jogadores podem explorar livremente a mansão depois de coletar Almas Ressecadas suficientes com seu Farol das Almas, uma lanterna especial criada para capturar os vários fantasmas menores espalhados pelos cômodos. Embora Zeke enfrente sua missão sozinho, ele conta com a ajuda de Madame Leota e de seis fantasmas amigáveis, que oferecem dicas e itens ao longo da jornada. Conforme Zeke resolve quebra-cabeças, conclui várias tarefas e ajuda a livrar a casa de seus espíritos malignos, esses companheiros espirituais fornecem Gemas da Alma, que ampliam o poder do Farol das Almas. Quando estiver totalmente carregado, Zeke poderá enfrentar o espírito principal, Atticus Thorn, no confronto final.