Em Persona 3, assuma o papel de um estudante do ensino médio, que ficou órfão quando jovem e foi recentemente transferido para a Gekkoukan High School em Port Island. Apenas alguns dias depois que ele chega ao dormitório da escola, ele é atacado por um Shadow. O assalto desperta sua Persona, Orfeu, sua única chance de derrotar essa criatura da noite. Ele logo descobre que compartilha essa habilidade especial com outros alunos em sua nova escola. A partir deles, ele aprende sobre a Hora das Trevas, um tempo oculto que existe entre um dia e o outro, repleto de Sombras que estão diminuindo a velocidade de reivindicar vítimas conhecidas como The Lost - pobres almas que inexplicavelmente foram transformadas em zumbis ambulantes. Sob a supervisão do presidente da escola Shuji Ikutsuki, ele se junta a seus novos amigos para enfrentar essa ameaça maligna... Com sua escola como o principal campo de batalha, você é forçado a fazer malabarismos entre duas vidas: estudante de dia, defensor contra o mal à noite. E seus maiores desafios esperam por você na véspera de cada lua cheia.
