Kingdom Hearts Re: Coded é um remake de Kingdom Hearts Coded que foi lançado para celular, apenas no Japão. O jogo se passa após os eventos de Kingdom Hearts II, quando o Jiminy's Journal (onde os eventos de Kingdom Hearts I e II são registrados) fica infestado de bugs. Para decodificar as informações no diário e depurá-las, King Mickey, Donald, Goofy e Jiminy Cricket as digitalizam. Com a ajuda de um Sora digital, recriado a partir do código do Diário, eles começam a explorar os Mundos no diário para revelar o que está faltando.
Subir de nível e ganhar habilidades é feito instalando chips e desbloqueando habilidades de suporte e expansões de comando e acessórios na matriz de estatísticas. A Matrix também inclui Cheat Tuners que são usados para alterar elementos de jogabilidade, como dificuldade do jogo, taxas de queda de itens, etc.
Além dos elementos regulares de RPG de ação da série Kingdom Hearts, o jogo inclui elementos de jogabilidade de outros gêneros. Em alguns mundos ou batalhas contra chefes, a mecânica do jogo muda completamente. Alguns são níveis de rolagem lateral ou de tiro em terceira pessoa e até RPG baseado em turnos.
Depois de atingir um certo ponto no jogo, cada mundo pode ser revisitado para tentar obter pontuações mais altas, encontrar novas áreas e fazer algumas missões secundárias.
