No futuro, a humanidade foi escravizada em uma simulação de realidade virtual conhecida como Perfect. Essa simulação é controlada por uma entidade conhecida como Perfect1 e precisa ser destruída para desligar o sistema. Você é o Imercenário Número Cinco e é seu trabalho fazer isso.
De um laboratório secreto, você se conecta à simulação, que o envia para um lugar em Perfect conhecido como Garden. Cada entidade no jogo tem uma determinada classificação que determina suas capacidades ofensivas e defensivas. Você começa no nível 255, o mais baixo, e deve subir de classificação para derrotar Perfect1, que detém o nível 1. Para isso, você destrói Rithms de classificação mais alta, como as outras entidades no jogo são chamadas. Para passar de certas classificações, Rithms únicos no topo da hierarquia Perfect precisam ser destruídos.
Diferentes armas e power-ups podem ser coletados, e energia ofensiva e defensiva pode ser recarregada em torres de energia. No centro do Garden há um lugar chamado DOAsys, que funciona como uma zona neutra e um centro de cura. Lá, você pode conversar com outros Rithms e pedir dicas sobre como combater Rithms especiais e onde encontrar itens especiais. Essas sequências de diálogo são clipes de atores em trajes elaborados interpretando os Rithms.
Quando o jogador sai da simulação ou é violentamente forçado a sair, ele retorna ao laboratório, onde pode carregar e salvar um jogo e acessar estatísticas detalhadas sobre as viagens a Perfect.