No século 24, a humanidade foi para o espaço. A tripulação da nave estelar Swordfish está em um confronto com piratas espaciais quando a batalha piora. Em desespero, a tripulação ativa sua unidade de salto sem destino... e acaba sendo arremessada pela galáxia até o núcleo galáctico. O Swordfish, no entanto, está gravemente danificado com muitas baixas, incluindo o capitão. Apenas 26 da tripulação sobrevivem, e deles apenas 6 estão qualificados para o combate: o comandante, dois soldados, um mecânico e um médico e seis gigantes trajes mecanizados "Módulos" disponíveis para eles. Esses sobreviventes localizam o planeta Farworld, aparentemente colonizado por humanos. Lá eles descobrem que a colônia está sob ataque de alienígenas mecânicos implacáveis apelidados de "Berserkers". A tripulação do peixe-espada deve lutar contra os Berserkers e explorar a galáxia em busca de alguns meios para voltar para casa.
Cyber Knight é um RPG com um tema de ficção científica de estar perdido em uma galáxia alienígena. O jogo se passa em uma visão de cima para baixo para movimento em planetas e áreas, uma visão lateral para sequências de combate e um sistema de menu em primeira pessoa a bordo da nave Swordfish. O Swordfish pode viajar entre as estrelas, escaneando mundos em busca de informações. Se a nave puder pousar em um planeta, três tripulantes pilotando três Módulos (robôs gigantes) podem ser selecionados para desembarcar e explorar o planeta. Muitos planetas terão cidades ou pessoas vivendo neles com os quais se pode conversar para descobrir informações. Diferentes missões são atribuídas para encontrar os itens necessários para progredir. Não há sistema de moeda ou compra de itens. Em vez disso, muitos Berserkers derrotados deixam para trás "NeoParts", que podem ser trazidas de volta ao laboratório do Swordfish. A análise desses desbloqueios de peças Neo aprimora as estatísticas (resistência, agilidade, precisão, etc.) para os Módulos e novas armas para eles carregarem. Os seis módulos são únicos em estatística, e também os seis pilotos possuem habilidades diferentes.
O combate ocorre em combate baseado em turnos em um campo de 6x6 quadrados. Vistos de lado, os três módulos podem ser posicionados em relação aos inimigos para atacar, usando uma variedade de armas brancas e de longo alcance. A munição é ilimitada, mas cada módulo também carrega uma série de "opções" que são ataques consumíveis. Cada Módulo tem dois conjuntos de pontos de vida: um para o piloto e outro para o próprio módulo. Se qualquer um deles chegar a zero, o módulo será destruído. Para curar, o grupo carrega 10 kits de reparo e kits de primeiros socorros, que devem ser usados quando não estão em combate. Esses kits, bem como opções e pilotos ou módulos derrotados, podem ser restaurados retornando ao Swordfish.
